卧底行动有2种，都可以最多在战场上控制7名成员完成必要的目标：

【1】防御任务：我方小队要与特工配合，守护一个特定区域的终端。如果没有守护成功，那么最后的屏障就是传送天线。如果2个目标都失去，那么任务失败，后果很严重。

【2】骇客任务：我方小队要保护特工黑掉2个敌方终端，然后将特工护送到登机点。

叛军系敌人不是外星人，他们都是改造人或为了自己目的而行动的反XCOM势力，他们和外星人也有势不两立的情况，所以请不要把他们当成外星人的走狗。

叛军的装备可以说是原版XCOM装备的更酷版本，实际作战数值没有变化，只是样子更漂亮罢了。

叛军以小队部署，会人类系部队的所有能力。他们的亮点包括狙击，压制，医疗，爆破和支援等一系列小队战术，外加每次出现的数量很多，所以是需要小心应对的敌人。

叛军的武器很有个性，我方队员也可以使用缴获的武器，相信这是设计者为了满足大家对武器样式的需求而做出的扩展内容。

随着时间推移，叛军采取的花样也会增加。你好容易攒的钱，有可能一个不小心就被叛军掠走。所以我们要想一个一举歼灭叛军的方法。